Ігровий процес гри схожий з традиційними консольними платформерами, такими як Mega Man і N, які вимагають високої точності керування персонажем. Гравець керує маленьким квадратним, позбавленим шкіри персонажем, на ім'я Meat Boy (М'ясний Хлопець), який повинен врятувати свою подругу Bandage Girl (Пластир-Дівчинка) з рук Dr. Fetus (Доктор Зародок). Гравцеві необхідно, керуючи головним героєм і використовуючи здатність ковзати по стінах, провести його через рівні, що містять різні пастки, такі як циркулярні пилки, голки і сіль, і досягти Bandage Girl. Кількість життів необмежена, а після смерті Meat Boy відразу з'являється на початку рівня. Після проходження рівня гравцеві показують повтор, в якому одночасно відображаються останні 40 спроб проходження.